实验四 PCR扩增技术
pcr扩增
实验四
PCR扩增技术
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一.实验目的及背景
多聚酶链式反应(polymerase chain reaction)简称PCR技术,是80年 代中期发展起来的一种体外扩增特异DNA片段的技术。此法操作简便, 可在短时间内在试管中获得数百万个特异的目的DNA序列的拷贝,P CR技术虽然问世仅数年时间, 但它已迅速渗透到分子生物学的各个领 域,引起了生物技术发展的一次革命,目前它在分子克隆, 目的基础检 测,遗传病的基因诊断,法医学,考古学等方面得到了广泛的应用。 PCR技术实际上是在模板DNA, 引物和4种脱氧核苷酸存在的条件 下依赖于DNA聚合酶的酶促合反应,PCR技术的特异性取决于引物 和模板DNA结合的特异性。 反应分三步:①变性(denaturation);② 退火(annealing);③延伸(ex tension),反应过程见图。
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模板DNA在94℃条件下变性形成单链; 在5 5℃条件下根据目的基因两侧序列设计的引物分 别与其同源序列结合;70℃下在耐热性DNA 聚合酶Taq 酶催化下, 在4种dNTP存在条件下 延伸形成双链。完成一次循环。 接着又以新合成 的DNA为模板进行同样反应,如次往复循环30 次,由于每次循环目标DNA都以2n次幂扩增, 30次循环后目的DNA的量增加10 6-7倍。成 功的PCR反应要求反应有很好的特异性和相当 的扩增效率。 要达此目的PCR反应要注意以下 问题:
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1.
DNA模板:反应中DNA量在50ng~200ng左右。 且DNA纯度较高, 以增加反应特异性。 dNTP:反应体系中达100μM~200μM。 Mg2+:Mg2+是Taq酶的辅基,浓度在2.0mM左右,浓度太 低Taq酶活力降低;太高反应特异性降低。
2. 3.
4.
引物:根据目的基因两侧特定序列设计。引物约20碱基 左右;G+C含量在40 %-70%之间;引物内部不能有 回文序列;引物3’端不能互补。
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5.
Taq酶:它是从嗜热杆菌中提取的耐热性DNA聚合酶,
在95℃时30分钟还有50%活力。6. 7.
变性温度:在93~95℃之间使模板充分变性。 复性温度:55℃左右,此温度选择是根据模板和引物 配对结合强弱而定, 它是反应特异性的决定因素。
8.
延伸温度:70~72℃左右,为Taq酶最适反应温度。
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二.实验试剂及仪器
10×buffer: 500mM KCl 100mM Tris-HCl (pH9.0) 0.1% 1% 明胶 TritonX-100
MgCl2 4×dNTP: 模板: Taq酶:
2.5mM 1mM
引物:actin上, actin下 20ng/μl 5u/μl
PCR仪,凝胶成像系统,电泳系统
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PCR仪
凝胶成像系统
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三. 实验方法1.向无菌的200μl Eppendorf管中依次加入以下溶液 反应物 10×buffer 4×dNTP(1mM) 无菌水 Taq酶 (1
U/ul) 引物 上 引物 下 模板DNA (20ng) 总体积 体积 2.5μl *5 2.5μl *5 18μl *5 0.5μl *5 0.5μl *5 0.5μl *5 0.5μl 25μl 12.5 12.5 90 2.5 2.5 2.5 混合,吸取24.5μl
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2. 3.
反应体系混匀,离心 在PCR仪上按以下方式循环
94℃变性 5分钟94℃变性 45秒 30个循环 55℃退火 45秒
72℃延伸 1分钟72℃延伸反应10分钟。4.
取5μl反应液加4μl Loading buffer在1.5%琼脂糖凝胶上120伏,电 泳2小时。 在凝胶成像系统上观察记录实验结
5.
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四. 结果分析记录实验结果,并估测PCR扩增产物分子量。
问题与讨论: 1.简述PCR基本原理 2.进行一次成功的PCR反应应注意哪些问 题?。
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