基于小波分析法的蛋白质结构研究

用小波的方法预测了一个已知结构蛋白质的二级结构,并把它同互连网蛋白质结构预测服务及其他结构预测软件得到的二级结构进行比较。结果表明：该方法可以较好地确定蛋白质的二级结构且不必进行同源蛋白质序列的联配。在预测未知结构的蛋白质序列方面,该方法与其他方法相比,预测结果并无显著差异,这说明小波分析法可以用于蛋白质结构研究,若与其他方法结合用于结构预测,将会起到更好的作用。

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第3 6誊

第 4期

西安交通大学学报J OUR NAL O IAN JAO F X I TONG UNI R I VE STY

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№4

20 0 2年 4月

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文章编号：2 3 9 7 2 0 ) 40 1—4 0 5 8 X( 0 2 0—4 40

基于小波分析法的蛋白质结构研究吴晓明，王波，程敬之(西安交通大学生命科学与技术学院， 4 .西安 1 0 9 0

摘要：用小波的方法预测了一个已知结构蛋白质的=级结构，并把它同互连网蛋白质结构预测服务及其他结构预测软件得到的：级结构进行比较 .果表明：方法可以较好地确定蛋白质的二级结该结构且不必进行同源蛋白质序列的联配.预测未知结构的蛋白质序列方面，方法与其他方法相在该比 .测鲒果并无显著差异 .预这说明小波分析法可以用于蛋白质结构研究 .与其他方法结合用于若结构预，会起到更好的作用 .将

关键词：蛋白质；:级结构；级结构：三小波变换；水自由能疏

中图分类号；Q7文献标识码：A l W a e e alssUs d i h t d fPr t i t u t r v ltAn y i e n t e S u y o o en S r c u eW u Xio l g."rn a ni n￣a g Bo. e gJigz i n n h

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wa ee n lssa d t ec m p rs n o h e utwih t e s c n a y s r cu e c ur d b h v lta ay i n h o a io ft e r s l t h e o d r tu t r sa q ie y t e s r ieo n e n tp o en sr c u ep e it na ds mes r

c u ep e it n s fwa ea ep ee— e v c fI tr e r ti tu t r r dci n o tu t r rd ci o t r r r s n o o td Th e ut n ia et a h sme h d c n b s d t o e a tt es c n a ysr c u eo r— e. e rs lsi dc t h tt i t o a eu e of r c s h e o d r tu t r fp o t l n o sn tr q kema ig ai n e to o l g r t i e u n e . I h r dc in f ena d d e o e u k n l m n fh moo y p o en s q e c s n t e p e it so g o u k o tu t r r t i e u n e, t e r s l b an d b sn h sme h d B e sm i r t n n wn s r c u e p o en s q e c s h e u t o t ie y u ig t i s to r i l O a t a r m t e eh d .I r v st a v lta ay i c r b s d i h t d f r t i tu— h tfo o h r m t o s tp o e h twa ee n lss at eu e n t esu yo o ens r t p t r . I o u e fc mbn d wi t e e h iu s t e ut ud b r rcs . ie t o h rtc n q e .isr s lswo l emo ep e ie h

Kew r s r ti;eo d r tcu e trir r cu e za ee ta s om; y rp o i f e y od:p oen sc￣ a y s t r;et ys ut r;c v l r n/ r h d o h bc re u a t, te eg nr

所有蛋白质都由不同的氨基酸连接而成 .基氨酸的排列次序构成蛋白质的化学结构 .即一级结构 . 蛋白质的一级结构决定了蛋白质的周期性结构，也就是蛋白质的二级结构 .而决定了整个肽链完整从的空间构像——三级结构.白质的三级结构确定蛋了蛋白质在生命活动中的重要功能.

氨基酸之间的区别在于不同的氨基酸有不同的侧链 .同的侧链决定了各个氨基酸有不同的特性 .不 包括疏水作用 .研究表明：水作用及疏水与亲水

的疏

平衡在蛋白质结构与功能的各个方面都起着重要的作用 .

收稿日期：2 0 92.作者简介：吴晓明( 9 2 ., 0 10 0 17~)男博士生；程敬之 (系人)联，男，教授，博士生导师.基金项目 教育部教育振兴行动计划”资助项目.