生物化学综合实验报告(2)
将100mg溴乙锭溶于蒸馏水或电极缓冲液100ml,棕色瓶内封好,避光保存。EB是诱变剂,配制和使用时应戴乳胶手套,并且不要将该溶液洒在地面或桌面上。凡是沾污过EB的器皿或物品,必须经专门处理后,才能进行清洗或弃去。 (22)1%琼脂糖 2.实验器材
离心机;752紫外分光光度计,研钵,三角瓶,烧杯,玻璃棒,匀浆器,离心管,恒温水浴箱(60度,100度),量筒,吸量管,真空干燥器,紫外分光光度计,石英比色皿,电泳仪,电泳槽,微量移液器,紫外检测灯,移液管(1、2、5ml),试管及试管架,凝胶塑料托盘,大小烧杯,一次性塑料手套,紫外反射投射仪,洗瓶,胶头滴管,卡尺。
操作步骤:
1.植物组织中DNA的提取及纯度鉴定(小白菜)
(1)从冰箱取出冷冻30min以上的小白菜幼嫩组织剪碎,放入研钵中并加入12ml研
磨缓冲液研磨成匀浆。
(2)将匀浆倒入三角瓶内,加入等体积的氯仿-异戊醇混合液,充分震荡半分钟,以
脱组织蛋白,然后离心(10000r/min)5min,小心地吸出上层清液备用,弃去中下层含有细胞碎片,变性蛋白质,氯仿等残物。该过程循环2~3次
(3)将收集的上层溶液倒入三角瓶中,再加入等体积的氯仿-异戊醇混合液,充分震
荡半分钟,以脱组织蛋白,然后离心(10000r/min)5min,用吸管吸出上层核酸水同液,移于烧杯中。
(4)用吸管沿烧杯壁缓缓加入2倍体积预冷95%的乙醇,然后用玻璃棒轻轻搅动,将出现的纤维沉淀缠绕在玻璃棒上。
(5)将上述沉淀溶解在PH=8.0, 2ml的TE溶液中,搅拌到完全溶解后,加入RNase溶液,使其最终浓度为50-75ug/mL,在37度下保温30min,以除去RNA,然后加入等体积氯仿-异戊醇混合液,在三角瓶中,震荡半分钟,离心(10000r/min)5min。收集上层水溶液,再次除去残留的蛋白质和所加的RNase.
(6) 按照4的程序加乙醇后,将DNA沉淀挑出(若是无法挑出DNA沉淀,则离心5min (10000r/min),弃去上清液,底部为DNA沉淀),再将DNA溶解于PH=8.0的2ml的TE溶液中,即得到纯化的DNA溶液。
(7)DNA纯度测定。采用DNA紫外吸收特性进行测定,取少量样品,加PH=8.0的TE
溶液稀释至一定浓度,测A260和A280的值,如A260/A280=1.8,蛋白质含量不超过1.3%,DNA纯度合乎质量标准。
NDA浓度(ug/mL)=×稀释倍数 (L为比色杯厚度,一般为1cm; 0.020为每mL溶液中含1ugDNA钠盐时的吸光值;A260为260nm波长处光吸收值)
2. 肝脏中DNA的提取及纯度鉴定
(1) 取新鲜肝脏(约10g),用0.14mol/L氯化钠-0.15mol/L乙二胺四乙酸钠溶液洗去
血液,剪碎,加入10mL 0.14mol/L氯化钠-0.15mol/L乙二胺四乙酸钠溶液,置匀浆器中研磨,待研成糊状后,浆糊状物离心5min(10000r/min),弃去上清液,沉淀用0.14mol/L氯化钠-0.15mol/L乙二胺四乙酸钠溶液洗2-3次。 (2) 向上述沉淀物加入0.14mol/L氯化钠-0.15mol/L乙二胺四乙酸钠溶液,使总体积为
4mL,然后滴加10%SDS溶液0.5mL,边加边搅拌。加毕,置60度水浴保温10min(用细玻璃棒经常搅拌),等溶液变得粘稠时(可能不明显)取出冷至室温。此步操作系使大分子脱氧核糖核蛋白从细胞核中溶出,核酸与蛋白质分离。 (3) 加入4mol/L氯化钠溶液1.6mL,使氯化钠最终浓度达到1mol/L搅拌10min,加入约
1倍体积的氯仿-异戊醇混合液,震摇20min,离心5min(10000r/min).收集上层水相,去掉在氯仿与水相之间的变性蛋白质沉淀;向上层水相徐徐加入1.5-2倍预冷的95%乙醇,DNA沉淀即析出,离心5min(10000r/min)去掉上清,收集沉淀(DNA粗品)。 (4) 将DNA粗品置于2.7mL0.015mol/L氯化钠-0.0015mol/L柠檬酸三钠溶液中溶解,再
加入0.3mL1.5mol/L氯化钠-0.15mol/L柠檬酸三钠溶液,搅匀,加入1倍体积的氯仿-异戊醇混合液,震摇10min,离心5min(10000r/min),小心地吸取上层水相(含NDA钠盐),弃中层变性蛋白;收集上层水相再加入一倍体积的氯仿-异戊醇混合液,震摇10min,离心5min(10000r/min),小心地吸取上层水相,弃中层变性蛋白。反复几次直到中间层蛋白凝胶层消失。向收集的上层水相加入2倍体积预冷的95%乙醇,DNA即沉淀析出。离心5min(10000r/min),弃去上清液,沉淀为较纯的DNA. (5) 将上述所得沉淀溶于2mLTE缓冲液中,加入RNaseA溶液至终浓度为20mg/L混匀,
在37度水浴中保温30min。 (6) 向经RNaseA 消化后的DNA溶液中加入1倍体积的氯仿-异戊醇混合液,震摇5min,
离心5min(10000r/min),小心地吸取上层水相(含DNA),弃中层变性蛋白,重复抽屉2-3次。 (7) 向除尽蛋白质的上清液中徐徐加入2倍体积预冷的95%乙醇,DNA及沉淀析出。离
心5min(10000r/min),弃去上清液,再用预冷的70%乙醇洗一次,室温倒置干燥。 (8) 将上步所得更纯的DNA沉淀溶于2mL 0.015mol/L氯化钠-0.0015mol/L柠檬酸三钠溶液中备用(供定性鉴定或定量测定)。 (9) 将DNA样液适当稀释,移入光径为1cm的石英比色皿,并以0.015mol/L氯化钠
-0.0015mol/L柠檬酸三钠溶液作为空白对照。在紫外分光光度计上分别于260nm,280nm和230nm波长处进行测定,计算A260/A280和A260/A230比值的大小来鉴定DNA样品的纯度。
3. 二苯胺法测定核酸的含量 (一)DNA标准曲线的制作
取8支试管,编号,按下表加入试剂
加毕,摇匀,于60℃恒温水浴中保温1小时,(或于沸水中煮沸15分钟,冷却测0.D595nm值。)以光密度为纵坐标,DNA含量(ug/ml)为横坐标,绘制标准曲线。 (二)样品的测定
取2支试管,各加0.2ml待测液加蒸馏水稀释至2毫升,再加4毫升二苯胺试剂,摇匀,其操作步骤与标准曲线的制作相同。根据测得的光密度值,从标准曲线上查出相当该光密度DNA的含量,按下式计算出样品中DNA的百分含量。
DNA含量/毫升待测液=标准曲线查得值×稀释倍数
DNA产率(%)
含量/毫升 总体积新鲜鲜肝(g) 10
6
100
4. DNA的琼脂糖凝胶电泳(实验一,二样品) 一、DNA电泳样品制作
取2只清洁、干燥、无菌的Eppendorf管,编号,分别加入25μL样品溶液,然后加入5μL 6×电泳缓冲液,混匀,放入冰箱保存。 二、1.0%琼脂糖凝胶板的制备
1. 用配套挡板将凝胶塑料托盘短边缺口封住,置水平玻板或水平工作台面上,将样品槽模板(梳子)插进托盘长边上的凹槽内(距一端约1.5cm),梳齿底边与托盘表面保持0.5-1mm的间隙,安置好后保持静置状态。
图5-1 凝胶托盘的组装 1. 托盘 2. 挡板 3. 梳子
2. 称取0.3克琼脂糖置于小锥形瓶中,加入30mlTBE稀释缓冲液,在电炉上(或微波炉中)加热融化,轻轻摇匀,避免产生泡沫。
3. 待琼脂糖冷却至放在手背不觉太烫手(约60℃)后,滴一滴EB,然后将琼脂糖溶液在靠近挡板一侧连续地倒入托盘内(注意中间不要间断),使凝胶缓慢而连续地展开直至在托盘表面形成一层约3mm厚均匀胶层(7.1×9.0cm)。胶内不要存有气泡,室温下静置约20分钟。
4. 待凝固完全后,双手均匀用力轻轻拔出样品槽模板(注意勿使样品槽破裂),则在胶板上形成相互隔开的样品槽。
5. 取下封边的挡板,将凝胶连同托盘放入电泳槽平台上,倒入大量TBE稀释缓冲液直至浸没过凝胶面2-3mm,要防止样品槽内窝存气泡,可以用微量注射器挑除。 三、加样
用微量注射器或移液枪样品液,分别加入到胶板的不同加样槽内,每个槽(5× …… 此处隐藏:2983字,全部文档内容请下载后查看。喜欢就下载吧 ……
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