分子生物学 - 图文(2)
(2) 操纵区(operator)
操纵区是指能被调控蛋白特异性结合的一段DNA序列。
操纵区常与启动子邻近或与启动子序列重叠,当调控蛋白结合在操纵区序列上,会影响其下游基因转录的强弱。 操纵基因为一段含有28bp 旋转对称的回文结构 。(氨基酸与碱基之间形成特异的氢键) (3) 调控基因(regulatory gene)
调控基因是编码能与操纵序列结合的调控蛋白的基因。 调控蛋白可分为
阻遏蛋白(repressive protein):与操纵区结合后能减弱或阻止其调控的基因转录; 激活蛋白(activating protein):与操纵区结合后能增强或起动其调控的基因转录。
效应物(effector)某些特定的物质能与调控蛋白结合,使调控蛋白的空间构像发生变化,从而改变其对基因转录的影响; 诱导剂(inducer)
阻遏剂或辅助阻遏剂(corepressor) 转录调控机制
负调控(negative regulation)系统
调节基因的产物是阻遏蛋白,其与结构基因特异位点的结合,阻止了RNA聚合酶的起始转录。只有当阻遏物缺乏或失活,结构基因的转录才能开启。 正调控(positive regulation)系统
调节基因的产物是激活蛋白 ,当其处于活化状态时与启动子结合以及和RNA 聚合酶的相互作用帮助结构基因的转录起始 。
衰减子 沉默子 各种应答元件
小分子对基因表达的调节 可诱导操纵子
调节分解代谢,分解代谢的底物作为诱导物;只有当诱导物存在时,结构基因才能开始转录; 可阻遏操纵子
调节合成代谢 ,合成代谢的最终产物作为辅阻遏物 ;只有在辅阻遏物缺乏时,结构基因才能开始转录,当辅阻遏物达到一定量,便会关闭结构基因的转录。 原核生物基因表达调控的类型
表达调控都是通过调节基因的产物(阻遏物或激活物)与小分子诱导物或辅阻遏物之间的相互作用来实现的。 原核生物基因表达的调控可以分为四种类型:
?可诱导的负调控:诱导物与阻遏物结合,基因表达;
?可诱导的正调控:诱导物与失活的激活物结合,基因表达; ?可阻遏的负调控:辅阻遏物与失活的阻遏物结合,基因抑制; ?可阻遏的正调控:辅阻遏物与激活物结合;基因抑制;
(二)原核生物转录起始调控
——大肠杆菌乳糖操纵子(Lac Operon) 大肠杆菌的乳糖代谢状况
当细菌在含有葡萄糖和乳糖的培养基中生长时,通常优先利用葡萄糖,而不利用乳糖。只有当葡萄糖耗尽后,细菌才可能充分利用乳糖。 当葡萄糖耗尽,环境中存在乳糖时,细菌停止生长,经过短时间的适应,才能利用乳糖,细菌继续呈指数式繁殖增长。
没有乳糖时,lac操纵子处于阻遏状态。调节基因低水平、组成性表达产生阻遏蛋白R,(10分子R/cell)。R以四聚体形式与操纵子o结合,阻碍RNA聚合酶与启动子P的结合,阻止了基因的转录起动。但R的阻遏作用不是绝对的,R与o偶尔解离,使细胞中还有极低水平的?-半乳糖苷酶及透过酶的生成。
有乳糖存在时,乳糖受? -半乳糖苷酶的催化转变为别乳糖,与R结合,使R构象变化,R四聚体解聚成单体,失去与o的亲和力,而解离, RNA聚合酶可以从启动子向3‘端移动,于是基因转录开放,使? -半乳糖苷酶在细胞内的含量可增加1000倍。即乳糖对lac操纵子起诱导作用。 3. 大肠杆菌乳糖操纵子 的正调控机制 正调控因子
CAP 或称CRP(cAMP 受体蛋白) CAP 具有两个结合域 与cAMP结合; 和启动子结合。
CAP-cAMP与启动子lac P的结合是激活转录的必要条件。
乳糖操纵子同时受到正、负两个调控系统:只有当CAP-cAMP与启动子(P)结合,阻遏蛋白从lacO分离,结构基因才开始转录。 乳糖操纵子的降解物阻遏机理
代谢物基因激活蛋白(Catabolite gene Activation Protein,CAP),又称cAMP受体蛋白(cAMP Receptor Protein,CRP)属于激活蛋白的一种,对乳糖操纵子进行正调节。 葡萄糖的浓度与细胞中cAMP浓度呈反相关关系:葡萄糖降解物能抑制腺苷酸环化酶的活性,并活化磷酸二酯酶的活性,从而降低cAMP的浓度,抑制转录。 CAP结合位点
在lac操纵子的启动子lacP上游端有一段序列与lacP部分重叠的序列,能与CAP特异结合,称为CAP结合位点(CAP binding site)。 CAP分子内分别有DNA结合区和cAMP结合区。当CAP与cAMP结合后,就可结合到CAP结合位点上,促进转录。
CAP与这段序列结合时,可增强RNA聚合酶的转录活性,使转录提高50倍。相反,当有葡萄糖可供分解利用时,cAMP浓度降低,CRP不能被活化,lac操纵子的结构基因表达下降。
阻遏蛋白负调节与CAP正调节的协调
当阻遏蛋白封闭转录时,CAP对该系统不能发挥作用;
LacP是弱启动子,在没有CAP存在时,即使没有阻遏蛋白与操纵序列结合,操纵子仍无转录活性;
只有在CAP存在且没有阻遏蛋白与操纵序列结合时,或者说只有高乳糖低葡萄糖时,操纵子发挥最大转录活性。 这种协调与细菌对碳源的优先利用相一致。 葡萄糖代谢对乳糖操纵子的作用 葡萄糖效应
当细菌在含有葡萄糖和乳糖的培养基中生长时,通常优先利用葡萄糖,而不利用乳糖。只有当葡萄糖耗尽后,细菌才能充分利用乳糖。 实质是由葡萄糖降解物引起的阻遏作用,又称降解物阻遏。
结果:细胞表现为优先利用葡萄糖,只有在葡萄糖缺乏时,才能利用乳糖。 4.Ara操纵子
结构基因
araB基因:编码核酮糖激酶 araA基因:编码L-阿拉伯糖异构酶
araD基因:编码L-核酮糖-5-磷酸-4-差向异构酶
复合启动子区:有两个启动子Pc和PBAD,可以双向转录,其中Pc启动子和araO1重叠
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