分子生物学 - 图文
转录的基本情况
?转录:以DNA为模板,按照碱基互补配对原则,合成RNA的过程。 ?转录单位:被转录成单个RNA分子的一段DNA称为一个转录单位。
?转录单位可以是一个基因,也可以是多个基因(如操纵子)。 ?转录单位包括启动子和终止子。
转录的特点
选择性转录 不对称转录 转录后加工 有意义链(编码链) /反义链(模板链) DNA和RNA生物合成的比较
原料 引物 延伸方向 单链DNA模板 起点和终止 产物长度 产物序列 主要酶类 ?RNA链的生物合成起始于DNA模板的一个特定位点,并在另一位点处终止。
?忠实性:转录具有高度的忠实性,转录具有固定的起点和终点。但因RNA聚合酶缺乏自我校正机制,使得转录的忠实性低于DNA复制。
复制 dNTP 小段RNA作引物 5‘→3‘/双向 两条链同时作模板 复制原点,(终止序列) DNA全长 与模板碱基互补: A-T,C-G DNA聚合酶、引物酶、 解旋、解链酶类 DNA连接酶 转录 NTP 不需 5‘→3‘/单向 一条链(反义链)模板 启动子,终止子 局部片段 与模板碱基互补: A-U,T-A,C-G RNA聚合酶(α2ββˊσ) 终止因子ρ因子 DNA指导下的RNA聚合酶 1. 原核生物RNA聚合酶 全酶:核心酶+σ因子 σ因子:起始阶段
识别启动子,负责模板链的选择和转录的起始; 不同的σ因子识别不同的启动子,从而表达不同的基因, 核心酶:(α2ββ‘)延伸反应
① 与DNA非特异结合,5‘→3‘移动,解链和聚合反应; ② 选择正确的rNTP底物并催化磷酸二酯键的生成; ③ 能识别转录终止信号,停止转录。
2. 真核细胞RNA聚合酶
与转录起始和终止有关的DNA结构 启动子(promoter)
RNA聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA序列。 终止子(terminator)
DNA上与转录终止有关的序列。 增强子(enhancer)
远上游序列,-100以上,也可以出现在下游。能使与其邻近的基因转录频率明显增加的DNA序列。 1. 原核生物启动子 ? ? ?
转录起点,多为嘌呤; Pribnow框 (结合位点)
Sextama框 ( 识别和初始结合位点)
类型 细胞内定位 催化转录产物 对鹅膏蕈碱的反应 Ⅰ 核仁 rRNA前体 耐受 Ⅱ 核质 mRNA前体 极敏感 Ⅲ 核质 5SrRNA tRNA 中度敏感
TATAAT (TATPuAT ),-10 序列。 TTGACA ,-35 序列。 决定启动子的强度。 ? ?
天然启动子中二者之间距离 多为15 ~20bp ,17bp 时转录效率最高。 终止信号存在于RNA聚合酶已经转录过的序列之中。
2. 原核生物终止子 分类:
1 不依赖蛋白因子的终止作用;
2 依赖于蛋白因子(即ρ因子)的终止作用; 结构共同特点:
在终止点之前有一段回文序列 ,两个重复部分(7 ~22bp ) 之间有一段不重复区段隔开,导致转录后产生茎环结构 。 2.1 不依赖ρ因子的终止作用
终止子的回文序列中富含G-C碱基对;
在回文序列的下游方向常有6~8个A-T碱基对;
3.2
RNA聚合酶Ⅱ的启动子
特点
通用型启动子(无组织特异性) 结构最复杂
位于转录起始点的上游 由多个短序列元件组成 组成
核心启动子元件 上游启动子元件 3.2.1 核心启动子元件
指保证RNA聚合酶Ⅱ转录正常起始所必需的、最少的DNA序列,包括转录起始位点及转录起始位点上游TATA区 转录起始位点:帽子位点,通常为A,两侧为若干嘧啶核苷酸; TATA框 常在-25bp左右,相当于原核的-10序列; 作用: 选择正确的转录起始位点,保证精确起始 3.2.2 上游启动子元件 包括CAAT盒和GC盒 CAAT盒:-70~-80bp,
一致序列为GGC/TCAATCT GC盒:GGGCGG:-80 ~ -110bp 作用: 控制转录起始频率。 3.2.3 增强子(enhancer)
即远上游序列,-100以上,能使与其连锁的基因转录频率明显增加的DNA序列。 性质
增强效应明显;
增强效应与其位置和取向无关;
多为重复序列,核心序列TGGAAA/TTT ; 组织和细胞特异性; 没有基因专一性;
增强子单元的协同作用和倍增效应; 原核生物和真核生物的转录 1. 原核生物转录过程 1.1 起始阶段
转录空泡 ?封闭二元启动子复合物:全酶+DNA双链 ?开放二元启动子复合物:全酶+解链DNA ?三元复合物:全酶+DNA+二核苷酸
(RNA) 1.2 延伸阶段
ρ因子六聚体的蛋白质,亚基的分子量为50kd。 ?σ因子解离,核心酶催化,在模板指导下沿5‘→3‘延伸RNA链;
?转录泡:DNA解链部分保持17bp左右,DNA-RNA杂交链维持12bp; ?DNA前方不断解链,后方重新缔合双链;新生的RNA链从杂交链中解离;
1.3.1 依赖于Ρ因子的终止作用 ρ因子的活性
具有NTP酶和解旋酶活性;
促使新生的RNA链从三元转录复合物中解离出来,从而终止转录。 1.3.2 不依赖ρ因子的终止作用
?依赖于终止子的结构。
机制:终止子中含有回文序列,致使新生的RNA链产生茎环结构;在回文序列后紧接多
个T结尾,使茎环结构后出现poly(U),与DNA模板上的poly(A)作用力较弱;RNA聚合酶出现延宕。 2.真核生物转录特点 ? ? ? ? ? ?
染色质和核小体结构对转录有深刻影响。 真核细胞RNA聚合酶高度分工。
转录的正常进行还需要许多被称为转录因子的蛋白质因子的参与。 启动子序列不同,且有启动子以外的序列参与调节基因的转录。 真核细胞内转录与翻译不存在偶联关系。 真核生物的转录产物多为单顺反子。
1. 真核生物mRNA的加工
mRNA的前体:核内不均一RNA (hnRNA )
不依赖ρ因子的终止作用 ?5‘端加帽:mG; ?3‘端加尾:polyA;
?剪接 :剪除内含子,拼接外显子; ?链内部核苷酸甲基化修饰。
7
1.1 5’端帽子
?
5’端帽子结构:
?
mRNA帽子的功能:
? ? ?
不同的帽子:
? ? ? 1.2 结构:
poly(A),多聚(A)尾巴大约40~250个左右的聚腺苷酸。 功能:
是mRNA由细胞核转移至细胞质所必需的形式; 提高了mRNA的稳定性。
? ?
3‘端非编码区中一种叫做加尾信号序列的控制。 多聚腺苷酸聚合酶催化转移;
不同的真核生物的mRNA具有不同的帽子; 同一种真核生物也常具有不同的帽子。
帽子0是核糖体识别必须的,帽子1和2具有增进识别的作用。
提供核糖体对mRNA的识别信号; 增加mRNA的稳定性(没有自由的5‘端); 促进某些RNA的合成。
m7G,以5‘,5‘ 磷酸酯键与 pppA或pppG相连的二核苷酸,即m7GpppX。
3’端尾巴
1.3 mRNA的甲基化
主要是N6-甲基腺嘌呤(m6A) 频率:1/1000;
hnRNA中已存在; 功能:对mRNA前体的加工起识别作用。 2. rRNA的前体加工
E.coli 的rRNA有三种:16S,23S和5S。 其初始转录物多为多顺反子。 rRNA转录后加工包括:
剪切 : 前体被RNaseⅢ 、RNaseR 等剪切; 修饰: 修饰酶进行碱基修饰;
装配: rRNA 与蛋白质结合形成核糖体的大、小亚基。 2.1 真核生物rRNA转录后加工 初始转录本为45S前体, 18S …… 此处隐藏:4089字,全部文档内容请下载后查看。喜欢就下载吧 ……
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