2014级硕士生生物信息学期末考核试题

2014级硕士生生物信息学期末考核试题

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（可能用到的软件或网址： PubMed; BLAST； nucleotide； MIM； ExPaSy; Swiss Prot）；

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一家临床实验室使用基因芯片在鼻咽癌组织中筛选病变复发或转移时发生甲基化的基因。 结果提示， 在人类染色体3找到逾百这样的基因。以下给出两条基因的cDNA序列， 请根据提供的条件进行比对， 然后回答以下问题：

1. 这两个基因的名称（主要的别名？）？列出得分最高的三条序列比对的主要参数值。它

们在人类染色体上的定位？

2. 它们是否编码蛋白质产物？ 这些蛋白产物有哪些主要的功能？

3. 这些基因的编码产物是否与癌症的发生有关？ 请列出近期主要的文献。

序列1：

1. ORIGIN

1 aaaagctcag aatttccagc agcggctcct tcctccagga gtctctggtg cagctggggt

61 ggaatctggc caggccctgc ttaggccccc atcctggggt caggaaattt ggaggataag

121 gcccttcagc cccaaggttg tcctcgacca gtcccgtgcc atggcagccc acctgcttcc

181 catctgcgcc ctcttcctga ccttactcga tatggcccaa ggctttaggg gccccttgct

241 acccaaccgg cccttcacca ccgtctggaa tgcaaacacc cagtggtgcc tggagaggca

301 cggtgtggac gtggatgtca gtgtcttcga tgtggtagcc aacccagggc agaccttccg

361 cggccctgac atgacaattt tctatagctc ccagctgggc acctacccct actacacgcc

421 cactggggag cctgtgtttg gtggtctgcc ccagaatgcc agcctgattg cccacctggc

481 ccgcacattc caggacatcc tggctgccat acctgctcct gacttctcag ggctggcagt

541 catcgactgg gaggcatggc gcccacgctg ggccttcaac tgggacacca aggacattta

601 ccggcagcgc tcacgggcac tggtacaggc acagcaccct gattggccag ctcctcaggt

661 ggaggcagta gcccaggacc agttccaggg agctgcacgg gcctggatgg caggcaccct

721 ccagctgggg cgggcactgc gtcctcgcgg cctctggggc ttctatggct tccctgactg

781 ctacaactat gactttctaa gccccaacta caccggccag tgcccatcag gcatccgtgc

841 ccaaaatgac cagctagggt ggctgtgggg ccagagccgt gccctctatc ccagcatcta

901 catgcccgca gtgctggagg gcacagggaa gtcacagatg tatgtgcaac accgtgtggc

961 cgaggcattc cgtgtggctg tggctgctgg tgaccccaat ctgccggtgc tgccctatgt

1021 ccagatcttc tatgacacga caaaccactt tctgcccctg gatgagctgg agcacagcct

1081 gggggagagt gcggcccagg gggcagctgg agtggtgctc tgggtgagct gggaaaatac

1141 aagaaccaag gaatcatgtc aggccatcaa ggagtatatg gacactacac tggggccctt

1201 catcctgaac gtgaccagtg gggcccttct ctgcagtcaa gccctgtgct ccggccatgg

1261 ccgctgtgtc cgccgcacca gccaccccaa agccctcctc ctccttaacc ctgccagttt

1321 ctccatccag ctcacgcctg gtggtgggcc cctgagcctg cggggtgccc tctcacttga

1381 agatcaggca cagatggctg tggagttcaa atgtcgatgc taccctggct ggcaggcacc

1441 gtggtgtgag cggaagagca tgtggtgatt ggccacacac tgagttgcac atattgagaa 1501 cctaatgcac tctgggtctg gccagggctt cctcaaatac atgcacagtc atacaagtca 1561 tggtcacagt aaagagtaca ctcagccact gtcacaggca tattccctgc acacacatgc 1621 atacttacag actggaatag tggcataagg agttagaacc acagcagaca ccattcattc 1681 catgtccata tgcatctact tggcaaggtc atagacaatt cctccagaga cactgagcca 1741 gtctttgaac tgcagcaatc acaaaggctg acattcactg agtgcctact ctttgccaat 1801 ccccgtgcta agcgttttat gtggacttat tcattcctca caatgaggct atgaggaaac 1861 tgagtcactc acattgagag taagcacgtt gcccaaggtt gcacagcaag aaaagggaga 1921 agttgagatt caaacccagg ctgtctagct ccgggggtac agcccttgca ctcctactga 1981 gtttgtggta accagccctg cacgacccct gaatctgctg agaggcacca gtccagcaaa 2041 taaagcagtc atgatttact taaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2101 aaa

//

序列2：

2. ORIGIN

1 gcgggcgggc gggcgaagct gggctcgggg ccaagcgagg tctagccgga gcgactgtgc 61 cccgcctcct gggcggagcg ggcggctccc catggtcaga gcctcgtgcc ggctcggcag 121 cgcccggacg ccgagcccag cgcgtcggcc ccccggcgtg cgggcgtctc agagccgcgg 181 aggggccgcc gggaccgttt cagcgtggcg gcgctggtgc tggcgttggc cctggaggac 241 ggccccgagt gatggctggc gcctgcctcc cgggtgtctc ccgggtacag atggagtcgt 301 cccgcggccg ccggcggcaa ggtcggcagc tgcgaggcca agagagaccc caggacacac 361 acagctgcct cccggtgcga gaagaagacc ccggcttgag agtgagatgg cgtttaatga 421 ttgcttcagt ttgaactacc ctggcaaccc ctgcccaggg gacttgatcg aagtgttccg 481 tcctggctat cagcactggg ccctgtactt gggtgatggt tacgttatca acatagcacc 541 tgtagatggc attcctgcgt cctttacaag cgccaagtct gtattcagca gtaaggccct 601 ggtgaaaatg cagctcttga aggatgttgt gggaaatgac acatacagaa taaacaataa 661 atacgatgaa acgtaccccc ctctccctgt ggaagaaatc ataaagcggt cagagtttgt 721 aattggacag gaggtggcct ataacttact tgtcaacaac tgtgaacatt ttgtgacatt 781 gcttcgctat ggagaaggag tttcagagca ggccaaccga gcgataagta ccgttgagtt 841 tgtgacagct gctgttggtg tcttctcatt cctgggcttg tttccaaaag gacaaagagc 901 aaaatactat taacaattta ccaaagagat attgatattg aaggaatttg ggaggaggaa 961 aagaaacctg gggtgaatac ttattttcag tgcatcatta ctgttccaga ttcctatgat 1021 ggatggcaga ctctttaata aattgcttac tgatattatc ttaaaaaaaa aaaaaa //