Spectrum Living Image 40软件操作流程(2)
点击Imaging Wizard
进行生物发光三维成像点击
Bioluminescence,并选择下图
红框所示的DLIT
选择标记所用探针
探针选定后,软件会自动给出对应波长,对于生物发光成像,软
件会自动给出要进行成像的波段,如左上图虚框所圈波段,对于荧光成像,还需在下面步骤选择透射点以进行多图成像
进行荧光三维成像点击Fluorescence,并选择下图红框所示的FLIT
Spectrum Living Image 40软件操作流程
对于荧光成像,在下图界面设置好其
对于生物发光成像,在下图界面设置
他相应参数后,点击Transillumination
好其他相应参数后,点击Next即可
Setup后,进行透射点的选择
对于生物发光,点击Next之
后,序列图将呈现在下图中
根据二维成像结果,选择需要
进行透射成像的点,绿色代表
点已选上,选择完毕后,所设
置序列图将在下图中显示
序列图设置完毕后,点击Acquire Sequence按钮,软件将自动开始序列图的获取
Spectrum Living Image 40软件操作流程
序列图获取完毕后,各单张结果将显示在如下所示的对话框中,左图为生物发光,右图为荧光,接下来将进行表面拓扑成像以及信号的三维重建
6.2 进行表面拓扑成像重建
图像获取完成之后,接下来首先要进行所拍摄小鼠体表的表面拓扑图像绘制,即获取小鼠的轮廓结构,具体操作如下:
在工具栏中,点击展开Surface Topography工具条(红框所示),通过Subject下拉列表选择实验拍摄对象,通过Orientation下拉列表选择小鼠放置的体态(Dorsal表示背部朝上,Ventral表示腹部朝上),选择完成后点击Reconstruct,将出现左下图所示,要求用户选择需要进行表面拓扑成像的区域(通过绿色选框选取),然后点击Next按钮,将会出现一个对话框(右下图)表示出已选好的区域(紫色表示),可通过滑动条来选取制定区域,点击Finish按钮,软件即可自动完成表面拓扑结构的绘制。
表面拓扑结果图
Spectrum Living Image 40软件操作流程
6.3 生物发光信号三维重建
生物发光三维重建结果图,在
给出结果的同时,在工具栏的
Results选项中也同时给出一些
数据结果,对于结果的分析将 在下面章节做详细介绍
勾选Select all,点击Reconstruct,软件将自动完成生物发光三维信号的重建,结果见下图
Spectrum Living Image 40软件操作流程
6.4 荧光信号三维重建
荧光三维重建结果图,在
给出结果的同时,在工具
栏的Results选项中也同时
给出一些数据结果,对于
结果的分析将在下面章节 做详细介绍
勾选Select all,点击Reconstruct,软件将自动完成荧光三维信号的重建,结果见下图
Spectrum Living Image 40软件操作流程
6.5 三维结果分析
生物发光或荧光三维结果的分析过程一样,以下以生物发光三维结果为例,介绍三维结果的分析操作。
首先介绍一下上图中3D浏览工具条中各个选项的功能,如下:
工具选项
鼠标选择下拉列表 坐标轴线 坐标轴面 立体圈选框 栅格圈选框 对象归位、放大 旋转
功能描述
通过选择不同的鼠标指示形式,可对图像实现拖拽、旋转、放大等功能
点击后可在结果图中显示X/Y/Z坐标轴线 点击后可在结果图中显示X/Y/Z坐标轴面
点击后整个鼠体将会被一个立体框圈定,可手动移动、旋转整个鼠体
点击后鼠体的中心面将会被一个栅格平面圈定,可手动移动、旋转整个鼠体
选择下拉列表,可对鼠体进行归位及放大处理 点击后整个鼠体可以逆时针方向旋转
点击后将在左边三个侧面图中出现测量线标,通过
距离测量
测量线标可测量3D信号距离不同位置的距离信息,测定的数据将直接出现在测量线上方
点击后拖动鼠标圈选3D信号,在Tool Palette工具
定量测定
栏中的3D Tools工具条中的Source选项中的最下方的Measured Sources中,数据信息包括3D信号的发光强度、体积等
点击后选定3D信号,可copy该3D信号的定量信息点击后可以图片的形式保存3D结果
Spectrum Living Image 40软件操作流程
除了上述3D浏览工具条之外,3D Tools工具条是另一个分析工具条,包括4个模块,Surface模块主要对图像的表观信息进行调整,Source模块主要调节信号的表观并显示定量数据,Registration模块用于加载器官模拟图,Animate模块用于制作3D效果演示flash,各功能的详细说明请参见软件的User Guide。
显示定量结果
对位工具,实现器官图与小鼠的准确对位
选择老鼠模型及摆放形式后选择需要叠加的模拟器官图
Spectrum Living Image 40软件操作流程
7、 结果的保存和调出
7.1 结果的保存
对于结果的保存,有如下图所示几种方式,其中第1、2、3中方式保存的为整个数据文件夹包含图像获取的所有信息,保存后的文件必须用本软件打开,而第4中方式以图片格式保存,可直接用Windows操作系统中安装的图像处理软件打开。
1、点击File下拉列 表,通过Save或 Save as方式保存
2、通过点击存盘按钮进行保存
7.2 结果的调出
对于结果的调出,有如下几种方式,一般用第2种方式可获得更加直观和详细的信息。
Spectrum Living Image 40软件操作流程
7.3 多个结果图放在一起
对于多个单张结果图,有时需要放在一起比较,即放在一个假色条中比较,这样可以保证每个图中的信号值范围一致,比较才有意义,以下介绍如何将多个结果图放在同一个假色条中:
在上面的结果图中两张图片虽然显示在了一起,但是假色条并没有显示出来,在右边工具栏的Image Adjust工具条中,可以发现有一个Individual选项是被勾选的,去掉勾选后,假色条将显示出来(如下图),通过调节Individual Color Scale中的Min值和Max值,可以改变图中表示出的信号范围
首先通过点击Browse按钮打开所要浏览图片,然后按住键盘的Ctrl键的同时选择需要放置在一起的图片,这时所选图片将会以灰色表示已选,之后点击Load as Group按钮将出现如下结果图
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