Spectrum Living Image 40软件操作流程
Spectrum Living Image 40软件操作流程
Spectrum Living Image 4.0软件操作流程
本流程主要介绍Spectrum的Living Image 4.0软件的应用,包括参数介绍、生物发光、荧光二维及三维成像的图像获取及数据分析
1、 控制面板参数介绍
关键参数,决定灵敏度
整个图像的获取过程都通过该控制面板操作,其中曝光时间、bin值及光圈大小是最为关键的参数,直接影响图像获取的质量。 曝光时间(exposure time)
曝光时间决定了信号强度,曝光时间越长,信号强度越高,实验时应根据实际情况设定适当的曝光时间,初次实验若不知道合适曝光时间,可选择Auto曝光,仪器会自动检测一个合适的曝光时间以成像,当信号较弱时可适当增加曝光时间以获取较佳信号。注:生物发光成像的曝光时间为分钟(min)级别,而荧光成像的曝光时间为秒(sec)级别,实验时应注意参数设定。
Spectrum Living Image 40软件操作流程
Bin值(Binning)
Bin值表述的是将多少像素作为感光单元,bin值越大则表示应用更多的像素作为一个感光单元,因此,bin值越大则灵敏度越高,而分辨率会有所牺牲,当信号强度较弱时可适当增加bin值以获取信号。
光圈大小(f/stop)
光圈大小决定了光的透过量,光圈越大,穿过光圈到达CCD的光越多,面板中的数字为F/stop中的分母数字,因此,数字越小代表光圈孔径越大,透过的光越多,当信号较弱时可通过增大光圈(减小数字)而增强信号探测能力。
Large Binning (16)
Medium Binning (8)
Small Binning (4)
f/1
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视野范围(Filed of View)
视野范围用于调节观测的视野大小,共有A/B/C/D四档可选,分别代表不同大小的视野范围,实验时根据一次观察小鼠个数选择合适的视野范围进行成像。
FOV A: 4.0 cm FOV B: 6.5 cmFOV C: 12.5 cm FOV D: 21.5 cm
成像聚焦(Focus)
成像的聚焦包含自动聚焦和手动聚焦功能,在用小鼠进行成像时,一般默认成像对象的高度为1.5cm,仪器会自动完成聚焦,在用其他对象进行成像时(如大鼠),可调节Subject height参数,设定合适的聚焦高度,也可在Focus下拉选项中选择
聚焦设定
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2、 生物发光二维成像的图像获取
勾选Luminescent、Photograph及overlay选项,设置好曝光时间(生物发光曝光时间为分钟级别)、bin值、光圈大小及视野范围等参数(软件有默认参数,可按照默认参数成像,若效果不佳,则再调整各参数,调整的次序按照曝光时间>bin值>光圈大小顺序调整),Emission Filter选项设置为open,Photograph选项的参数一般情况无需调整,所有参数设定完毕后点击Acquire按钮即可开始成像。
成像完成后,在得到结果图的同时会弹出实验信息记录对话框(下图右框),可输入相关实验信息以记录实验情况,一次可最多同时选择5个选项进行记录,记录完成后,记录的相关信息会反映在结果图中,点击结果图中的info按钮即可看见。
Spectrum Living Image 40软件操作流程
3、 荧光二维成像的图像获取
荧光二维成像与生物发光二维成像的操作流程基本类似,只是多了一些参数的设定,另外,对于需要扣除背景的成像,需应用到荧光光谱分离技术,该技术的操作流程将在第4节中详细说明,本节主要介绍获取单张荧光二维图片的操作流程。荧光二维成像可选择使用反射照明或透射照明进行荧光激发,当信号在皮下等较浅部位时可选择反射照明成像,而当信号位于肝脏等较深部位时可选择透射照明(Transillumination)进行成像。
对于反射照明成像具体步骤如下:勾选Fluorescent、Photograph及overlay选项,设置好曝光时间(荧光曝光时间为秒级别)、bin值、光圈大小及视野范围等参数(软件有默认参数,可按照默认参数成像,若效果不佳,则再调整各参数,调整的次序按照曝光时间>bin值>光圈大小顺序调整),根据标记所用探针的激发光及发射光波长,选择合适的激发光(Excitation)及发射光(Emission)滤片,Photograph选项的参数一般情况无需调整,所有参数设定完毕后点击Acquire按钮即可开始成像。
选择荧光成像模式
透射照明
选择滤光片
对于透射照明成像,其他步骤与反射照明成像相同,只是需要选择Transillumination选项,点击Setup按钮进行透射点的选择,对于单张图片的获取只需选择一个点。
绿色代表点已选上
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4、 荧光光谱分离
Spectral Unmixing是一种将背景荧光信号与荧光探针信号分离的光谱分离方法。其应用主要包括两方面:1、将特异性荧光信号从组织自发荧光中分离出来;2、将不同的探针信号分开,用于多种探针同时成像。这里以反射荧光成像为例,详细介绍应用Living Image 4.0进行Spectral Unmixing的具体步骤。更详细的说明请参见UserGuide。
点击Sequence Setup按钮,进行序列图的成像设定,可点击Add按钮手动添加并设定多图成像参数,但这样比较复杂,目前的软件都已具有Imaging Wizard功能,该功能相当于一个参数设定向导,可引导使用者进行包括unmixing在内的多种功能的完成(如下图):
点击Imaging Wizard 按钮,进入设置向导
选择Fluorescence选项,按照向导指示完成unmixing设定操作(如下):
选择探针类型,如果所用探针下拉列表中包含则直接选择该探
针,如果列表中没有则在下拉列表最下方有Input EX/EM,可自行
生物发光成像 输入探针的激发光和发射光波长
荧光成像
3种波长扫描获
取方式,通常使
用发射光扫描
方式(Emission
Scan),即固定
激发光波长,选
择不同发射光
波长成像
选择Spectrum unmixing
图,蓝色虚框圈选的即为将扫描的波段
Spectrum Living Image 40软件操作流程
其他参数设定与控制面板中参数设定相同 Subject
点击Next 点击Acquire Sequence按钮,将开始序列图的获取,结果如下
获取的原始序 列图,将基于这 些序列图进行
光谱分离
在图像分析工具栏中点击展开Spectral
选择需要进行光谱分离的区域,可
Unmixing工具条,选择进行光谱分离
通过滑动条改变区域大小,紫色表
的波长,点击Start Unmixing按钮
示已选定区域,通常使用软件默认选择的紫色区域即可
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选择需要进行
光谱分离的成
分
2
显示光谱分离 光信号
显示光谱分离结果,左上图为分离得到的背景光信号,右上图为分离得到的特异性探针信号,左下图为用两种假色表示的合成图,发表文章需要的为右上图的探针信号图,后续的定性定量分析均选择此图进行,双击此图后便可开始后续分析,分析操作将在下列章节介绍
点击左图中的Spectra按钮,可显示线性光谱图,详细显示背景光谱 …… 此处隐藏:2803字,全部文档内容请下载后查看。喜欢就下载吧 ……
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