DNASTAR中文使用说明书(5)

需要满足两个标准：切割一或两次，用Apo I切割。我们手动过滤器包括频率过泸器的单一切点的内容，所以他自动的覆盖了频率过泸器的结果。下述过泸器一览表允许我们随意编辑、组合各

个过泸器。

l 从Map Document，单击过泸器调色板工具（在窗左上的漏斗图标）打开过泸器一览表（如下）。当前应用的所有过泸器都出现于窗口的左边。

l 为了除掉Apo I过滤器，点击选中它，从左窗口拖到右边的窗口，单击应用即可。现在由于只有Two-cuts-max过泸器被应用，所以序列上的酶切位点数目立即增加了。

l 把Apo I过滤器拖回，放在And旁，单击Apply再次应用Apo I过滤器，序列上的酶切位点数目又立即减少了。（如果把Apo I过滤器拖回，放在Or旁，单击Apply再次应用Apo I过滤器，序列

上的酶切位点数目不会改变，因为Apo I过滤器是Two-cuts-max过泸器的一部分）。 l 按上面的方法把两个过滤器都去除。

使用Must Cut Here / Don’t Cut Here调色板工具

Must Cut Here / Don’t Cut Here工具是另一种酶切位点过滤限制方法。我们将用这个方法再次重复上面的操作。 l 从MAP MENU，选Site & Sequence。

l 向下滚动，直到你看在大的向右指的箭头，上写“histone”。

单击选中。点击Don’t Cut Here调色板工具（红色园圈起的剪刀样图标），去除所有切割选定区的酶切位点。（点击Must Cut Here工具——剪刀样图标——序列上将展示所有切割选定区的

酶切位点。）

这样，仅仅剩下那些不切割选定区的位点。 显示酶信息

内切酶编辑器（Enzyme Editor）使你能够查看内切酶的各种相关信息，包括其名字，识别序列，isoschisomers，种类，价格，销售公司和有效性等详细的信息。你对这些信息可以进行添加

或删除操作。

l 打开酶编辑窗（如左），双击任意一个酶的名字。 l 箭头显示酶识别序列和切割位点。

l 你可以按照“GeneQuest”上的方法在序列上添加新Feature，并作注释。 环形展示

你可以以环形图展示环形或线性序列，但是，如果序列是线性的，MapDraw会提示你。如果你想在环形序列上进行酶切位点限制，那末，我们前面提到的Don’t Cut Here filter完全可以做到 这一点。

l 通过点击过滤器调色板工具检查当前是否只有Don’t Cut Here过泸器应用。如果已经应用，则Don’t Cut Here过泸器应该在过泸器一览表的左边的窗口里，而其他的过滤器在右边。如果

这不是这样，请进行调整。

l 从MAP MENU，选择Circular Illustration，打开左边的窗口。（如果此时有太多的酶切位点，你可以加入其他的过泸器）。

l 通过OPTIONS MENU的Drawing Size调整图画的大小。2条红线相会的角是你可以做的最小图画的范围。在窗口内点击任何位置，图形大小将显示为那末大。 l 单击同意。 ORF图

l 从MAP MENU，选ORF Map打开右边显示的六读框的开放读框窗口。默认的终止和开始codons可以使用指定的遗传密码。方法见EditSeq。

l 从OPTIONS MENU中选择ORF Criteria可以设定参数。你能调整最小的ORF长度，定义上游启动子和距上游启动子的距离，选定后单击同意即可。

l 放大ORF以查看翻译的序列。方法是点击调色板工具中Zoom In （有＋的图标），接着，单击分析界面。重复这些2步直到你能看翻译。 显示选择

MapDraw’s OPTIONS MENU提供各种指令允许你做下面的事情： l 选择1个或3个字母的编码。

l 显示不同的读框组合（Reading Frames 或 Line Layout）。

l 编辑用于翻译的遗传密码（Genetic Codes and Edit Selected Code）。酶显示可以选择垂直或者水平展示。 l 线性化环形序列（Linearize Sequence）。 l 显示不确定位点。 保存退出

l 从编辑菜单（EDIT MENU），选保存地图（Save Map）。 l 选择保存位置，命名。

l 单击保存（苹果计算机）或同意（视窗）。

l 从文件菜单（FILE MEN），选择放弃（苹果计算机）或者退出（视窗），电脑提示保存或放弃；选择保存，则你操作的所有结果都会保存起来，否则结果会全部丢失。

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