Meta分析系列之二_Meta分析的软件
meta分析软件全攻略哦
April,2012,Vol.4,No.22012442ChinJEvidBasedCardiovascMed,·89·
·循证理论与实践·
Meta分析系列之二:Meta分析的软件
JoeyS.W.Kwong,曾宪涛,田国祥,董圣杰
[中图分类号]R4
[文献标识码]A
[文章编号]1674-4055(2012)02-0089-03
Meta分析(Meta-analysis)已被公随着循证医学的发展,
认为客观评价和合成针对某一特定问题研究证据的最佳手
[1]
被视为最高级别的证据,成为循证决策的良好依据。段,
上一篇文章我们对Meta分析的类型进行了介绍
[2]
meta、rmeta等,常用的Meta分析程序包有metafor、可以完成
二分类及连续性变量的Meta分析外,还可以行Meta回归分析、累积Meta分析、非参数剪补法识别和校正有发表偏倚导致的漏斗图的不对称及对发表偏倚的Begg's检验和Egger's检验。同时可以绘制森林图、漏斗图、星状图(radialplot)、拉
Q正态分位图(Q-Qnormalplot)。其中,Metafor贝图以及Q-程序包是R软件Meta分析程序包中唯一可以进行混合效应
模型(包括单个、多个分类或连续性调节变量)拟合运算的。R有取代SPSS而与Stata、SAS并列为新的三大统计学据悉,
软件的趋势。2非编程软件
2.1ReviewManager
ReviewManager(RevMan)是国际Co-chrane协作网制作和保存Cochrane系统评价的专用软件,其
[5]
独特的功能是可以与Archie服务器连接。RevMan由北欧Cochrane中心制作和更新,基于的操作系统有操作系统还有
,为了适
应不同类型的需要,多种Meta分析软件被开发出来了。这
些软件中有的软件可以进行各种Meta分析,有的仅仅是针对某一种类型的Meta分析开发的;基于的操作系统有Win-dows、DOS、Linux和Mac;按照是否需要编程又分为编程软件和非编程软件(表1)。这些软件为行Meta分析提供了很好的支持,但也为评价者的选择带来了疑惑。鉴于此,本文拟对当前常用的Meta分析的软件进行简介,以期为使用者提供参考。
1编程软件
1.1StataStata是基于C语言的一个功能强大而又小巧玲珑的统计分析软件,最初由美国计算机资源中心(ComputerResourceCenter)研制,现为Stata公司的产品。1985年Stata1.0版问世,从4.0版起进入Windows时代,当前最新版本为
[3]12.0,操作系统还有Linux和Mac。Stata的许多高级统计
Windows、Linux和Mac。当前最新版本为5.1.6,任何非商业目的的使用者均可免费下载及使用(http://ims.cochrane.
org/revman/download)。RevMan5.1与之前版本相比,界面更加方便友好,能够输入中文,增加了风险偏倚评估工具表(rsikofbiastables)、证据结果总结表(summaryoffindingsta-bles)、Z计算器(calculator,可输入效应量、可信区间、标准误、P值进行效应值的转化)、PRISMA文献检索流程图、值、森林图小数位数(2位与4位间)的调整等。
RevMan软件中设置了干预措施系统评价、诊断试验精方法学系统评价和系统评价汇总评价4类格确性系统评价、
Linux和MacOSX操作平台,式,支持Windows、可绘制森林Begg'S图及漏斗图,但不能行Meta回归分析、累积Meta分析、
Egger'S检验及绘制拉贝图等。检验、
RevMan是所有Meta分析软件中唯一可与GRADEprofil-6]
。RevMan是er软件相互导入进行证据等级评级的软件[1,
当前医学领域应用最为广泛的Meta分析软件。
模块均是程序文件(ado文件),并允许用户自行修改、添加和发布ado文件,用户可随时到Stata网站或者其他个人网站上寻找并免费下载所需的程序包安装后使用。Meta分析通过Stata的meta.ado模块完成,metareg、metabias等包括metan、常用命令,可完成二分类变量、连续性变量、诊断试验、单纯P值、单组率、剂量反应关系、生存资料的Meta分析,也可以完成Meta回归分析、累积Meta分析、网状Meta分析等几乎所有的Meta分析方法,还可以行Begg's检验和Egger's检验,可绘制Meta分析的相关图形,如森林图(forestplot)、漏斗图(funnelplot)和拉贝图(L'Abbeplot),亦可排除单个研究行敏Stata是目前Meta分析最受推崇的软件,感性分析。据悉,国外高质量杂志更倾向于接收StataMeta分析图形界面。1.2R
R软件是基于S语言的一种免费开放式的统计编程
环境,由Auckland大学RossIhaka和RobertGentlemen及其他志愿者开发,目前由R核心开发小组维护。R软件具备完整的数据处理、计算和作图功能,不依赖于操作系统可以运
Linux、Windows及Mac系统[4]。R部分统计功能行于Unix、
整合在R语言底层,大多数功能以程序包的形式提供,用户
project.org)获取最可以从R软件的官方网站(http://www.r-新的软件及相应的统计包(package)。R软件通过相应的程
序包完成Meta分析,具有功能完整、作图精美等优点。目前
基金项目:湖北医药学院2010年教学研究项目(2010017);湖北医药学院2011年度优秀中青年科技创新团队项目(2011CZX01)。
作者单位:442000十堰,湖北医药学院附属太和医院口腔医学中心(曾宪涛);香港中文大学医学院内科及药物治疗学系心脏科(JoeyS.W.Kwong);北京军区总医院第二门诊部(田国祥);苏州大学附属第一医院骨科(董圣杰)
E-mail:tian-gx@126.com通讯作者:田国祥,
doi:10.3969/j.issn.1674-4055.2012.02.002
2.2ComprehensiveMeta-AnalysisComprehensiveMeta-Analy-
sis(CMA)软件是由美国国家卫生研究院(NIH)资助、由英
国和美国Meta分析领域公认的一群专家制作并进行维护、更新的一款专程设计进行Meta分析软件,当前最新版本为2.1[7]。CMA为是一款商业软件,学术目的购买完整版为99analy-美元/年、终身版795美元,用户可从http://www.meta-sis.com/pages/demo.html免费下载体验版试用30d。CMA基于的系统为Windows,界面友好,能够输入中文,主要包括数据输入(dataentry)、数据分析(dataanalysis)和高分辨率图形(highresolutionplots)三个版块。CMA包除可以完成二分类及连续性变量的Meta分析外,还可以行Meta回归分析、累计Meta分析、单组率Meta分析、剔除单个研究行敏感性分析,但不能行诊断试验的Meta分析;可调整小数位数、绘制森林图、漏斗图等;可行Begg's检验和Egger's检验。CMA是目前非编程软件中唯一可同时行随机与固定效应模型、自动剔除单个研究行敏感性分析、及将多种类型数据(如二分类/连续性变量与OR值)合并分析的软件。
meta分析软件全攻略哦
·90·2012442ChinJEvidBasedCardiovascMed,April,2012,Vol.4,No.2
表1
软件名称操作系统
Meta分析界面版本可用性导入数据二分类变量连续性变量诊断试验数据
效应值及95%CI值多种格式数据P值
网状Meta分析累加Meta分析Meta回归异质性检验亚组分析小规模研究效应逐次剔除单个研究固定效应模型随机效应模型混合效应模型小数点位数调整Egger's检验Begg's检验森林图漏斗图拉贝图SROC图Q-Q正态分位图图形导出格式
StataW/M/L宏命令12.0收费√√√√√√√√√√P√√√√√√√√√√√√√√wmf/emf/png/tif/eps/pdf/ps
R
常用基于Windows系统的Meta分析软件的比较
RevManW/M/L专用图5.1.6免费×√√√
配套计算器转换配套计算器转化
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