生化分析读后感(蛋白质组学的研究方法)
关于“蛋白质组”的文献读后感
11检本2班张文轩2011220**
蛋白质组学(proteome)是指一个基因组、一个细胞或组织所表达的全部蛋白质的总和。蛋白质组学是后基因组时代研究的一个新领域,旨在通过在蛋白质水平上对细胞或机体基因表达的终产物进行定性和定量的研究,揭示生命活动的过程和规律及基因表达的调控机制。其研究范围包括:细胞、组织和体液中蛋白质数量和种类的确定和鉴别;细胞在正常生理情况和异常情况下(病理情况下)蛋白质表达水平的差异;蛋白质翻译的后修饰以及蛋白质的转运和定位;蛋白质和蛋白质、蛋白质和糖类、脂类、DNA、RNA的相互作用等。
蛋白质组是一个动态的概念,一个基因可能编码一种、数种蛋白质,也可能不编码蛋白质;一个蛋白质分子也可能由几个基因共同编码,这是蛋白质研究的难点。目前,蛋白质研究方法和技术的相对滞后已成为了制约蛋白质组学进一步深入的瓶颈。因此为了研究蛋白质需要多种方法。
生物质谱是六十年代始应用于一些挥发性化学物质的结构的研究方法。从细胞、组织或生物体液中提取的蛋白质样品经过二维凝胶电泳分离后,所分离的蛋白点用胰蛋白酶降解进行质谱分析,就可得到该蛋白质的肽谱图。从而根据肽谱图对蛋白质数据库进行检索,进行别和鉴定。此法具有很高的灵敏度和准确性。但同样有其局限性,质谱分析得到的质谱图的解析是一个相当费时费力的工作。其次,通过二维凝胶电泳获得的蛋白质图谱其蛋白点必须进行酶解,酶解的过程可能导致部分蛋白质和肽段的丢失。同时,基于二维凝胶电泳技术的生物质谱技术自动化程度较低,很多过程都需要人工参与,蛋白质样品及其酶解片段容易受到来自人的皮肤和头发的角蛋白的污染,因而可能对分析的准确性产生严重干扰。
将蛋白质芯片和质谱技术相结合可简化单纯生物质谱方法的复杂性,该技术把蛋白质样品的制备,生化反应和检测分析都集成在芯片上完成,便于检测分析,因而具有很强的实用性。它的缺点是抗体和蛋白质资源难以获得、选择和修饰基片存在技术缺陷、芯片的标记和数据处理亦存在技术发展瓶颈。尽管蛋白质芯片技术还存在各种各样的缺点,但是他具有高通量、高灵敏度、低上样量的显著特点使其在蛋白质组学的研究上优势明显。
科学研究虽然存在各种研究方法和切入点的不同,或许他们都存在各种缺点和瓶颈。值此骑虎难下之际,不妨将眼光放大,尝试结合别人的研究方法和技术设计或许会有意想不到的突破。
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