静息态功能磁共振数据分析工具包使用手册(3)

其中“Divide ALFF brain by the mean …”选中表示得到一个“低频振幅脑”的同时会将这个

“低频振幅脑”除以其mask内的均值（图 9的例子中的结果将会除以所有体素的均值，包括脑外，因为没有使用mask），并在文件名前加上”m“作为前缀；然后下一步就可以用这些结果（图 9的例子中的结果将会是mALFFMap_test_Control-1.img/hdr、

mALFFMap_test_ADHD-1.img/hdr）来做统计检验。

静息态功能数据分析使用方法

七、 详细使用说明

(一) 安装REST

1) REST运行环境要求：

a) MATLAB。推荐MATLAB 2006b（Windows XP），因为REST 2007 是在MATLAB2006b

（Windows XP）下开发的。MATLAB 6.5（Windows XP）、MATLAB2006b（Linux）经

测试是兼容的。 b) 至少1G内存。

c) 屏幕分辨率至少为1024 X 768。 2) 下载到的REST软件包应该是“rest_最后修改时间.tar.bz2”，如“rest_20071129.1639.tar.bz2”。 3) 解压缩到某个目录下，添加这个目录到 MATLAB 的路径： MATLAB -> File -> Set

Path... -> Add Folder...->Save->Close。如果已经安装有早期的REST版本，必须先卸

载掉以前的版本。

(二) 卸载REST

从MATLAB路径中删除REST所在目录：MATLAB -> File -> Set Path... -> Remove->Save->Close，然后删除REST所在目录。

(三) 启动REST

1. 启动 MATLAB。

2. 在MATLAB的命令窗口中输入“rest”（如图 10）

图 10、在MATLAB命令窗口中输入“rest”以启动REST

或者从MATLAB的工具箱中启动：点击 MATLAB Start -> 点击 Toolboxes ->

静息态功能数据分析使用方法

选择 "Resting State fMRI Data Analysis" ->点击"Start REST 2007"（如图 11）

静息态功能数据分析使用方法

图 11、从MATLAB工具箱中启动REST

如图 3为静息态fMRI数据分析工具包启动后的界面。

静息态功能数据分析使用方法

(四) 在REST中设置待处理的数据目录

在去线性漂移、滤波和计算功能连接、局部一致性、低频振幅时，REST以文件夹为单位，要求一个文件夹下只包含待处理的3D脑图像文件（每个3D脑图像文件对应一个时间点）。比如用SPM完成数据预处理后，必须把不需要REST计算的文件（如配准后生成的con_0002.img等）从文件夹中移出或者把需要REST计算的文件放到一个新的文件夹中。

可以在图 12所示区域中添加/删除一系列数据目录，实现批量计算。

图 12、在REST中设置输入参数：添加/删除一系列数据目录

点击“…”按钮将一次添加一个数据目录。也可以递归地添加一个目录下的所有子目录，

在图 12目录列表区域单击右键选择“Add recursively all sub-folders of a directory”，如图 13。如果要去除某个错误添加进来的目录，可以从右键菜单中点击删除，也可以按键盘上的“Del”或者“Backspace”。如果要去除所有已经目录，可以从右键菜单中选择“Clear all data directories”。

图 13、递归地添加一个目录下的所有子目录

(五) Mask 的设定

有三种类型mask：默认的mask、无mask、用户自定义的mask，如图14。使用mask会使REST只计算mask内的部分，会加快计算速度。

图 14、在三种类型的mask中选择，本图中设定为用户自定义的

mask