PCR-CTPP:一种基于错配技术的SNP分型方法的改良
为探讨两对交叉引物PCR(PCR—CTPP)技术的原理并提高SNP分型的准确性,以人类MTHFR基因1298位点突变为例,通过设计合理的引物、优化引物终浓度及复性温度等重建PCR—CTPP检测系统,对比常规PCR—CTPP和改良的PCR-CTPP检测系统的可靠性。结果表明,改良的PCR-CTPP检测系统更加准确,支持了常规方法存在理论缺陷的观点;批量鉴定结果进一步验证了改良方法的可靠性。该技术有望在
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技术与方法
P R- T P一种基于错配技术的 S P分型方法的改良 C C P: N王柯,章金涛 运玉霞,晓冰,陈阿群,王鹏,凯娟一一,一吴一一一王,张建营,一代丽萍 ,7
4
1州大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,郑州 4 0 0 .郑 50 1 2南省肿瘤流行病学重点实验室,郑州 4 05; .河 502 3州大学生物工程系,郑州 4 0 0; .郑 501 4郑州大学实验动物中心,郑州 4 0 5 . 50 2
摘要:为探讨两对交叉引物 P R(C—T P技术的原理并提高 S P分型的准确性,以人类 MT F C P RC P ) N H R基因 19 28位点突变为例,通过设计合理的 5物、优化 5物终浓度及复性温度等重建 P R C P检测系统,对比常规 j 1 C—T P P RC P C— T P和改良的 P RC P C -T P检测系统的可靠性。结果表明,改良的 P R C P C . T P检测系统更加准确,支持了 常规方法存在理论缺陷的观点;批量鉴定结果进一步验证了改良方法的可靠性。该技术有望在医学和分子生物学等领域广泛应用。
关键词:两对交叉5物 P R 物扩增受阻突变体系 P R S P分型; I C;四 I C;N人为错配;亚甲基四氢叶酸还原酶
I p o e e to m r v m n n PCR— CTPP:a S NP e t p n pp o c s d o g no y i g a r a h ba e nm im a c e h qu s t h t c ni eW ANG Ke一,ZHANG i . o, YUN u Xi 2 Jn Ta。4 Y_ . a,7 7
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n z o 5 0 1 C ia . p rm n pie oo yadBi aii, ol e o s sc e o biHe l Z egh uU iest Z eg h u40 0, hn; f c h y2 Hea yL br tr Tmo E ie ooy Z eg hu4 0 5, hn; . nn Ke a oaoyo u r pd milg, hn z o 50 2 C ia f 3 Dea t n Biegn ei, h nz o nv ri, h nz o 5 0 1C ia . p r tf on iern Z eg h uU i s Z eg h u4 0 0, hn; me o g e t y 4 L b rtr nma e t Z eg huU iest, h nz o 5 0 2 C ia . a oao A i l ne o hn zo nvri Z eg h u4 0 5, hn y C rf y
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v n i n l CR e t a o P - CTP n r v d P Pa di mp o e CR- P sc mp r d u i g r c n tu t dPC - TP e e t g s se i em s f - CT P wa o a e sn e o sr c e R- C P d t c i y tm tr n n o d sg i g a p o r t rme sa d o t z n n e l g t mp r t r n h n l o c n r t n o rme s T e i r v d e in n p r p a e p i i r n p i i g a n ai e e au ea d t e f a n e ta i fp i r . h mp o e mi n i c oP CR— P e e t n s se p o e emo ea c r t, ih s p o d t e v e o n n t e t e r t a e e t f o— CT P d tc i y tm
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v n i n l CR— e to a P CTP h r e s ae s d e fe e r l b l y o ei r v d meh d I x e t dt a i E T e l g— c l t y v r dt ei i t f h a u i i h a i t mp o e t o . t s p c e t h si r v d ie h t mp o e tc i u u db d l s d i ef l f e h q ewo l ewi ey u e t e d o me i ie a d mo e u a i l g . n nh i d cn n l c lr o o y bKe yw o d: CR P T ta- i r r s P - CT P; er rme p ARM S P CR; NP g n t p n; r fca/ ei e a emimac; T S e oy i g a t i il l r t s t h M HF i d b R
收稿日期: 2 1- 8 2;修回日期: 0 0 1- 5 000— 3 2 1- 0 0基金项目:国家自然科学基金项目(编号:3 8 2 8,8 0 26 ) 0 7 1 1 17 3 0,河南省高校科技创新人才支持计划 (号:2 1H T T 2 )河南医学科技编 O O As I0 7和攻关项目f编号:2 0 0 0 9资助 0930)
作者简介:王柯,硕士研究生,专业方向:遗传学。Emalwag e0 9 4 6 .o - i n k2 18@13cm:通讯作者:代丽萍,教授,博士,研究方向:肿瘤流行病学。 T l0 7 -7 84 4 Emalldi Z . uc e: 3 16 7 1 5;— i p a@ZUe .n: d
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