2011引物设计作业范例(2)

二级结构预测：

虽然内部有发夹结构，3’末端还是游离的。

正反向引物互补配对情况的检查：

取正向引物末端的四个碱基atct 反向互补后的序列为agat，在反向引物中没有找到

取反向引物末端的四个碱基ggtg

反向互补后的序列为cacc，在反向引物中没有找到 说明正反向引物没有互补配对配对现象。

PCR产物理论长度为： （3888168-3886753）+1+9+9= 1432 bp 蛋白质分子量预测：（3888168-3886753+1-3）/3*110= 51，810D （约52 KD） 110为氨基酸平均分子量

引物委托合成之E-mail

XXX公司：

请合成以下引物: TnaA-1（引物编号）：5’ gccggatccatggaaaactttaaacatct 3’ 29 bp

TnaA-2（引物编号）：5’ gggaagcttttaaacttctttaagttttgcggtg 3’ 34 bp 共合成2OD，每支1OD，价格1.2元/bp

送货地点：月亮大学药学院生物制药02班； 发票开：月亮大学 联系电话：1234567890

奥巴马

2105年13月32日

以下PCR卡片为林陈水课题组设计使用，版权所有，除作业外，不得翻印！！！！！！！

PCR卡片 No.

DNA产物名称 产物理论长度 模板 正向引物（10uM） 反向引物（10uM） dNTP 10X Buffer Mg2+ DNA Polymerase H2O Total Volume 采用程序所在目录 加量 μL μL μL μL μL μL μL μL μL bp 课题 目的 终浓度 种类： 备注 引物名称： 引物名称： 进货日期： 进货日期： 公司 公司 PCR过程设定

步 骤 1 2 3 4 5 6 7 8 9 温 度 94℃ 94℃ 55 ℃ ℃ GOTO 2 94℃ ℃ ℃ GOTO 5 72℃ 4℃ 步骤 1 2 3 4 5 6 温度 94℃ 94℃ ℃ ℃ GOTO2 72℃ 4℃ 10 min 10 min ----------- ------------ 时间 3min 30s s s 循环数 --------- 10 min 10 min ---------- ---------- s s s 时 间 3min 30 s s s 循 环 数 -------- 实验耗时： 小时 分 实验起始时间： ： 实验耗时： 小时 分 实验起始时间： ： 实验结果：□阳性： □阴性 实验者：_______________________ 结果分析：_胶浓度_ ％________________________________________________ 琼脂糖电泳结果示意： 日期：200 年_____月__ _日