Raji细胞基因组文库的构建与筛选
中南大学学报(医学版)JCentSouthUniv(MedSci)
185
ARTICLES
论著
Raji细胞基因组文库的构建与筛选
高建明1,李小玲2,李桂源2
(1.三峡大学医学院病理生理学教研室,湖北宜昌443002;2.中南大学肿瘤研究所,长沙410078)
【摘要]
It的:构建Raji细胞基因组文库,用EBVDNA探针对文库进行筛选。方法:Raji细胞基因
组DNA经BamHI酶切消化后。低熔点琼脂糖回收9~23kb的酶切DNA片段,通过匹配黏性末端与磷酸化的Lambda
DASH
II
BamHI酶切载体臂连接,在体外经包装系统包装成活的重组噬菌体,测定原始文库
与扩增文库的滴度,用同位素标记的EBVDNA探针对Raji细胞基因组文库进行筛选。结果:Raji细胞原始文库与扩增文库的滴度分别为1.8×105和2.8×108pfu/mL。文库经筛选获得4个阳性克隆,随机挑取1个阳性克隆稀释后铺平板作进一步杂交鉴定,发现所有噬菌斑均有杂交信号,证明该克隆确为阳性克隆。抽提该阳性克隆DNA,进行BarnHI酶切鉴定,证实插入片段的长度为8.5kb。经测序、BLAST序列比对,结果显示插入片段一侧为EBV
BamHI
W片段,另一侧与人类15号染色体RPll-665A22克
隆高度同源。结论:Raji细胞基因组文库的成功构建,为进一步克隆包含EBV整合位点的细胞基因组序列、探讨EBV整合参与肿瘤发生发展的分子机制奠定了基础。
[关键词]
Raji细胞;
Q781
基因组文库;[文献标识码]
构建;
A
筛选
l
[中图分类号][文章编号]672—7347(2008)03—01
85—07
Constructionandscreeningofgenomiclibraryfrom
GAOJian.min91,LIXiao.1in92,LIGui.yuan2
Raji
cells
(1.DepartmentofPathophysiology,SchoolofMedicine,ThreeGorgesUniversity,YichangHubei443002;
2.CancerResearch
Institute,XiangyaSchool
ofMedicine,CentralSonthUniversity,Changsha
41
0078,China)
Abstract:DNA
Objective
Toconstructthe
genomiclibrary
of
Raji
cellsand
screen
itbyEBV
probe.MethodsHighmolecularweightgenomicDNAofRajicellswasdigestedbyrestriction
enzymeBamHI.DNAfragmentsrangingfrom9to23sis,whichwereligatedwithLambdaDASHIIkaline
vector
kbwererecoveredbyagarosegelelectrophore-BarnHIarmspre-treatedwithcalfintestineal-
phosphatase(CIAP).Ligated
on
DNAwaspackedinvitrousingGigapackmgoldpackaging
ex—
tract.Thelibrarywasplatedgenomiclibrarywere105pfu/mL.while
XL1一blue
MRA(P2)host
The
strain.Titefingandscreeningofthe
library
was
Raji
performed.Results
primarytiteroftheRajigenomic
1.8×
thatoftheamplifiedlibrarywas2.8×108
EBVDNAprobe(EBV
pfu/mL.Plaques(1×105)were1),4
positive
clones
were
screenedwith32P.1abeledtained,and
genome5.327
ob—
1ofthe4positivecloneswaspickedoutrandomlyforthesecondroundofplaque
screen一
收稿日期(Date
of
reception)2007-08-31
高建明(1971.),男,江苏盐城人,博£,副教授,主要从事肿瘤病理生理学研究。
作者简介(Biography)
通讯作者(Correspondingauthor)李桂源,E mail:ligy@xysm.net基金项目(Foundationitems)
国家自然科学基金重点项目(30330560);国家自然科学基金项日(30470955)by
thekey
1.IIi8workw“supported
Science
projectof
of
NationalNaturalScienceFoundationof
China(30330560)andNationalNatural
Foundation
China(30470955).
中南大学学报(医学版),2008,33(3)
ing.Allthephageplaqueswerepositive.DNAofthepositiveclonewasextractedwithBarnHI.Thelengthoftheinsertedfragmentwas8.5kb.SequencingandvealedthattheinsertedfragmentsconsistedoftheBamHI -Wfragment665A22
on
at
one
andwasdigested
re—
BLASTanalysis
endandcloneRP11
li—
chromosome15
at
theotherend.Conclusion
a
The
successfullyestablishedgenomic
braryofRajicellswill
provide
basisforcloningthesequencesoftheEBVjunction
sitesandinter-
pretingthemechanismofoncogenesisofEBVintegration.
Keywords:
Rajicell;genomic …… 此处隐藏:15862字,全部文档内容请下载后查看。喜欢就下载吧 ……
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