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Raji细胞基因组文库的构建与筛选

来源:网络收集 时间:2026-05-25
导读: 中南大学学报(医学版)JCentSouthUniv(MedSci) 185 ARTICLES 论著 Raji细胞基因组文库的构建与筛选 高建明1,李小玲2,李桂源2 (1.三峡大学医学院病理生理学教研室,湖北宜昌443002;2.中南大学肿瘤研

中南大学学报(医学版)JCentSouthUniv(MedSci)

185

ARTICLES

论著

Raji细胞基因组文库的构建与筛选

高建明1,李小玲2,李桂源2

(1.三峡大学医学院病理生理学教研室,湖北宜昌443002;2.中南大学肿瘤研究所,长沙410078)

【摘要]

It的:构建Raji细胞基因组文库,用EBVDNA探针对文库进行筛选。方法:Raji细胞基因

组DNA经BamHI酶切消化后。低熔点琼脂糖回收9~23kb的酶切DNA片段,通过匹配黏性末端与磷酸化的Lambda

DASH

II

BamHI酶切载体臂连接,在体外经包装系统包装成活的重组噬菌体,测定原始文库

与扩增文库的滴度,用同位素标记的EBVDNA探针对Raji细胞基因组文库进行筛选。结果:Raji细胞原始文库与扩增文库的滴度分别为1.8×105和2.8×108pfu/mL。文库经筛选获得4个阳性克隆,随机挑取1个阳性克隆稀释后铺平板作进一步杂交鉴定,发现所有噬菌斑均有杂交信号,证明该克隆确为阳性克隆。抽提该阳性克隆DNA,进行BarnHI酶切鉴定,证实插入片段的长度为8.5kb。经测序、BLAST序列比对,结果显示插入片段一侧为EBV

BamHI

W片段,另一侧与人类15号染色体RPll-665A22克

隆高度同源。结论:Raji细胞基因组文库的成功构建,为进一步克隆包含EBV整合位点的细胞基因组序列、探讨EBV整合参与肿瘤发生发展的分子机制奠定了基础。

[关键词]

Raji细胞;

Q781

基因组文库;[文献标识码]

构建;

筛选

[中图分类号][文章编号]672—7347(2008)03—01

85—07

Constructionandscreeningofgenomiclibraryfrom

GAOJian.min91,LIXiao.1in92,LIGui.yuan2

Raji

cells

(1.DepartmentofPathophysiology,SchoolofMedicine,ThreeGorgesUniversity,YichangHubei443002;

2.CancerResearch

Institute,XiangyaSchool

ofMedicine,CentralSonthUniversity,Changsha

41

0078,China)

Abstract:DNA

Objective

Toconstructthe

genomiclibrary

of

Raji

cellsand

screen

itbyEBV

probe.MethodsHighmolecularweightgenomicDNAofRajicellswasdigestedbyrestriction

enzymeBamHI.DNAfragmentsrangingfrom9to23sis,whichwereligatedwithLambdaDASHIIkaline

vector

kbwererecoveredbyagarosegelelectrophore-BarnHIarmspre-treatedwithcalfintestineal-

phosphatase(CIAP).Ligated

on

DNAwaspackedinvitrousingGigapackmgoldpackaging

ex—

tract.Thelibrarywasplatedgenomiclibrarywere105pfu/mL.while

XL1一blue

MRA(P2)host

The

strain.Titefingandscreeningofthe

library

was

Raji

performed.Results

primarytiteroftheRajigenomic

1.8×

thatoftheamplifiedlibrarywas2.8×108

EBVDNAprobe(EBV

pfu/mL.Plaques(1×105)were1),4

positive

clones

were

screenedwith32P.1abeledtained,and

genome5.327

ob—

1ofthe4positivecloneswaspickedoutrandomlyforthesecondroundofplaque

screen一

收稿日期(Date

of

reception)2007-08-31

高建明(1971.),男,江苏盐城人,博£,副教授,主要从事肿瘤病理生理学研究。

作者简介(Biography)

通讯作者(Correspondingauthor)李桂源,E mail:ligy@xysm.net基金项目(Foundationitems)

国家自然科学基金重点项目(30330560);国家自然科学基金项日(30470955)by

thekey

1.IIi8workw“supported

Science

projectof

of

NationalNaturalScienceFoundationof

China(30330560)andNationalNatural

Foundation

China(30470955).

中南大学学报(医学版),2008,33(3)

ing.Allthephageplaqueswerepositive.DNAofthepositiveclonewasextractedwithBarnHI.Thelengthoftheinsertedfragmentwas8.5kb.SequencingandvealedthattheinsertedfragmentsconsistedoftheBamHI -Wfragment665A22

on

at

one

andwasdigested

re—

BLASTanalysis

endandcloneRP11

li—

chromosome15

at

theotherend.Conclusion

The

successfullyestablishedgenomic

braryofRajicellswill

provide

basisforcloningthesequencesoftheEBVjunction

sitesandinter-

pretingthemechanismofoncogenesisofEBVintegration.

Keywords:

Rajicell;genomic …… 此处隐藏:15862字,全部文档内容请下载后查看。喜欢就下载吧 ……

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