生物化学白皮书(4)
遗传密码作用:①体现编码氨基酸信息的密码:61个( 起始密码,AUG),以碱基配对的方式识别tRNA中的反遗传密码; ②不体现氨基酸信息的密码:3个(UAA、UAG、UGA)。 遗传密码特点*: ①方向性、②连续性、③简并性、④通用性、⑤摆动性。
(2)tRNA:由3′-CCA以酯键结合氨基酸,并通过不稳定性配对识别遗传密码,使氨基酸按mRNA信息指导“对号入坐”。
(3)rRNA:与多种蛋白质构成核糖体RNA,作为合成多肽链的场所。 小亚基中16srRNA与5′mRNA SD序列 (AUG附近)结合 ;
大亚基的P位(给位)在起始阶段进入起始氨基酰tRNA;延长阶段由肽酰tRNA占据,A位(受位)接受新的氨基酰tRNA,大亚基在延长阶段有转肽酶作用,能将P位(给位)进入起始氨基酰tRNA或肽酰tRNA中的氨基酰基或肽酰基与A位(受位)接受新的氨基酰tRNA形成肽键,使肽链延长;大亚基在终止阶段有水解酶作用,水解肽酰tRNA中多肽链。 大亚基的E位(exit site 排出位):排出空载tRNA。
2.反密码3'CGI5'与密码5'—3'的碱基怎样进行不稳定的配对?
答:按从5'→3'的阅读规则,反密码第一位I可与密码第三位U、C、A 配对,所以3'CGI5'可与密码5'GCU3'、5'GCC3'、5'GCA3'配对。 3.简述蛋白质的生物合成的过程,蛋白因子(原核)的作用? 答:(1)肽链合成起始:小亚基的16srRNA与5′mRNA SD序列结合后,起始氨基酰-tRNA与mRNA起始AUG密码配对再与大亚基结合,而形成翻译起始复合物的过程。
(2)肽链的延长:根据mRNA密码序列的指导,依次添加氨基酸从N 端向C端延伸肽链,直到合成终止的过程。每次循环分进位、成肽和转位三步。
(3)肽链合成的终止:当核蛋白体A位出现mRNA的终止密码后,多肽链合成停止,肽链从肽酰-tRNA中释出,mRNA、核蛋白体大、小亚基等分离的过程。 答:
原核生物蛋白因子作用 起始因子 生物功能
IF-1
占据A位防止结合其他tRNA IF-2
促进起始tRNA与小亚基结合
IF-3
促进大小亚基分离,提高P位对结合起始tRNA敏感性 延长因子
EF-Tu
促进氨基酰-tRNA进入A位,结合分离GTP EF-Ts
调节亚基
EFG
有转位酶活性,促进mRNA-肽酰-tRNA由A位EF-2 前移到P位,促进卸载tRNA释放 释放因子
RF-1
特异识别A 位中的UAA、UAG终止密码,诱导转肽酶改变为酯酶活性 RF-2
特异识别A 位中的UAA、UGA终止密码,同上。 RF-3
有GTP酶活性,能介导RF-1、RF-2与核蛋白体作用。
4.蛋白质生物合成中大亚基有哪些酶作用? 答: 转肽酶和水解酶的功能。
一.名词解释
1.基因表达:基因转录和翻译的过程,其产物为RNA或蛋白质。
2.管家基因:在一个生物个体的几乎所有细胞中持续表达的基因表达量恒定,不受环境因素影响。 3.启动子: 是操纵子调控序列中RNA聚合酶结合模板DNA的部位,也是控制转录的关键部位。 4.增强子: 指远离转录起始点、决定基因的时间、空间特异性、增强启动子转录活性的DNA序列。 5.操纵子: 转录是不连续分区段进行的,每一转录区段可视为一个转录单位,称为操纵子。它包括若干个结构基因及其上游的调控序列。 6.反义RNA:含有与特定mRNA翻译起始部位互补的序列,通过与mRNA杂交阻断30S小亚基对起始密码子的识别及与SD序列的结合,抑制翻译起始。 二.问答题
1.基因表达的方式,基因转录激活调节基本要素分别有哪些? 答:方式: 基本表达;诱导和阻遏。
基本要素: 特异DNA序列;调节蛋白;RNA聚合酶。
2.增强子的特点有哪些? 答:(1)由若干功能组件-----是特异性转录因子结合DNA的核心序列;
(2)其作用与启动子相互依赖,但对启动子无严格专一性,无增强子存在启动子通常不表现活性,无启动子时增强子也无法发挥作用,同一增强子可影响不同的启动子甚至原核启动子; (3)作用无方向性、特异性;
(4)对启动子远距离发挥影响,且必须先被蛋白质因子结合后,才发挥增强转录子作用。 3.转录调节因子的结构与模体种类?
答:结构:DNA结合域、转录激活域,有的还含有蛋白质-蛋白质结合域(常见的是二聚化结构域)。 答:种类:α-螺旋-转角- α-螺旋、亮氨酸拉链、锌指结构等。
4.解释乳糖操纵子调节机制,原核生物启动子元件有哪些保守序列?其碱基序列组成?该类序列起何作用?
答:乳糖操纵子调节机制:阻遏蛋白的负性调节、CAP的正性调节、协调调节 (1)阻遏蛋白的负性调节
①条件:单纯乳糖不存在——负性调节:结构基因表达抑制
阻遏蛋白+O基因→抑制位于P基因上的RNA聚合酶向结构基因方向移动。 ②条件:单纯乳糖存在——解除负性调节:结构基因表达
阻遏蛋白+别乳糖→复合物→阻遏蛋白失活,离开O基因→位于P基因上的RNA聚合酶向结构基因方向移动→结构基因表达,产生能利用乳糖的酶。 (2)CAP的正性调节
条件:单纯乳糖存在——正性调节:结构基因表达
CAP(分解代谢物基因激活蛋白)+cAMP→复合物→激活P基因上的RNA聚合酶向结构基因方向移动→结构基因表达,产生能利用乳糖的酶。 (3)协调调节
①阻遏蛋白存在,CAP对系统不发挥作用
②无CAP:无阻遏蛋白与操纵序列结合,操纵序列仍无转录活性
③单纯乳糖存在(无葡萄糖),细菌用乳糖作碳源:乳糖诱导下,通过前述过程启动乳糖操纵子转录,合成三种利用乳糖的酶。
④有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共存,细菌首先利用葡萄糖
当lac阻遏蛋白封闭转录时,CAP对该系统不能发挥作用;但如果没有CAP存在来加强转录活性,即使阻遏蛋白从操纵序列上解聚仍无转录活性。 答:
原核生物启动子元件的保守序列 碱基序列组成 -10区——TATA盒 TATAAT -35区
TTGACA
答:作用:共有序列决定启动序列的转录活性大小。 一.名词解释
1. DNA克隆: 应用酶学的方法,在体外将各种来源的遗传物质——同源的或异源的、原核的或真核的、天然的或人工的DNA与载体DNA结合成一具有自我复制能力的DNA分子——复制子,继而通过转化或转染宿主细胞、筛选出含有目的基因的转化细胞,再进行扩增、提取获得大量同一DNA分子,即DNA克隆,又称基因克隆、重组DNA或基因工程。
2.同源重组: 发生在同源序列间的重组称为同源重组,又称基本重组。同源重组的发生依赖两分子之间序列的相同或类似性。如果通过转化或转导获得的外源DNA与宿主DNA同源,那么外源DNA就可以通过同源重组方式整合进宿主染色体。
3.目的基因: 感兴趣的基因或DNA序列就是目的基因,又称目的DNA。目的DNA有两种类型,即cDNA和基因组DNA。
4.回文结构: 大部分Ⅱ类限制性核酸内切酶,识别位点的核苷酸序列呈二元旋转对称,通常称这种特殊的结构顺序为回文结构。 二.问答题
1.试述自然界基因重组的方式。
答:基因重组包括同源重组、特异位点重组和转座重组等类型。
(1)同源重组: 作为最基本的DNA重组方式,同源重组是指发生在同源序列间的重组,它通过链的断裂和再连接,在两个DNA分子同源序列间进行单链或双链片段的交换。又称基本重组。
(2)特异位点重组:是指由整合酶催化,在两个DNA序列的特异位点间发生的整合。 …… 此处隐藏:5843字,全部文档内容请下载后查看。喜欢就下载吧 ……
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