分子遗传图谱构建

第三章 分子图谱的构建

分子图谱构建的步骤：

1. 选择适合作图的DNA标记； 2. 根据遗传材料之间的DNA多态性，选择用 于建立作图群体的亲本组合； 3. 建立具有大量DNA标记处于分离状态的分 离群体或衍生系； 4. 测定作图群体中不同个体或株系的标记基 因型； 5. 对标记基因型数据进行连锁分析，构建标 记连锁图。

第一节 作图群体的建立

要构建DNA标记连锁图谱，必须建立作图群 体。建立作图群体需要考虑的重要因素包 括亲本的选配、分离群体类型的选择及群 体大小的确定等。

一、亲本的选配

① 首先要考虑亲本间的DNA多态性。 ② 选择亲本时应尽量选用纯度高的材料，并 进一步通过自交进行纯化。 ③ 要考虑杂交后代的可育性。 ④ 选配亲本时还应对亲本及其F1杂种进行细 胞学鉴定。

二、分离群体类型的选择

根据其遗传稳定性可将分离群体分成两大类： 一类称为暂时性分离群体，如F2、F3、F4、BC、 三交群体等，这类群体中分离单位是个体，一经 自交或近交其遗传组成就会发生变化，无法永久 使用。 另一类称为永久性分离群体，如RI、DH群体等， 这类群体中分离单位是株系，不同株系之间存在 基因型的差异，而株系内个体间的基因型是相同 且纯合的，是自交不分离的。这类群体可通过自 交或近交繁殖后代，而不会改变群体的遗传组成， 可以永久使用。

（一）F2代群体 代群体 优点： 优点： a) 自花授粉植物，还是异花授粉植物，建立 群 自花授粉植物，还是异花授粉植物，建立F2群 体都是容易的。 体都是容易的 缺点： a) 存在杂合基因型。对于显性标记，将无法识别 显性纯合基因型和杂合基因型。 b) 由于这种基因型信息简并现象的存在，会降低 作图的精度。 c) 为了提高精度，减小误差，则必须使用较大的 群体，从而会增加DNA标记分析的费用。 d) 不易长期保存，有性繁殖一代后，群体的遗传 结构就会发生变化。

（二）BC1群体 群体 优点： 优点： a) BC1群体中每一分离的基因座只有两种基因型， 群体中每一分离的基因座只有两种基因型， 群体中每一分离的基因座只有两种基因型 它直接反映了F1代配子的分离比例 它直接反映了 代配子的分离比例 。 b) 可以用来检验雌、雄配子在基因间的重组率上 是否存在差异 。 缺点： a) 不能长期保存。 b) 对于一些人工杂交比较困难的植物，BC1群体 也不太合适，因为一是难以建立较大的BC1群 体，二是容易出现假杂种，造成作图的误差。

（三）RI群体 群体 RI（重组自交系）群体是杂种后代经过多代 （重组自交系） 自交而产生的一种作图群体，通常从F2代 自交而产生的一种